Директором железнодорожной школы № 31 с 1940 по 1942 гг. был Халтурин Виктор Андреевич. Многие учителя и ученики ушли на фронт в первые месяцы войны.
О том, как жила школа в годы войны, мы узнали из воспоминаний бывших учеников: Ксенофонтовой (Голощаповой) Анны Алексеевны: «Из учителей первым на фронт ушел любимый учитель географии Зуев Михаил Иванович. Помню, он пришел в школу попрощаться, уже в стеганке, одетый для отправки. Мы, ученики, замерли и молча, долго смотрели на него, как будто прощались навсегда. На фронт ушли учителя: Трофимов Александр Викторович, Погребной Дмитрий Афанасьевич, Кирпичиков Григорий Федорович, Шоуви М. А., Прошкин Михаил Петрович». Анна Алексеевна в 1941-1942 учебном году училась в седьмом классе. Рассказывала, что учиться было трудно: ученикам школы не хватало учебников, не было тетрадей, ручек, перьев, писали в старых книгах между строчек. Кушать было нечего. Булка хлеба резалась на четыре части вдоль, а потом на маленькие кусочки примерно по 50 граммов. Такой кусочек ежедневно давали каждому ученику, а если кто отсутствовал, его порцию отдавали ученикам по очереди.
Фото. Учащиеся школы № 31. фото 27 мая 1941 года
Школа отапливалась плохо. Подадут платформу с углем, а он весь смерзшийся. Мальчишки из школы ходили его долбили, грузили в короб и на санях подвозили к кочегарке. После седьмого класса почти все мальчишки ушли работать. Из двух седьмых классов 1 сентября 1942 года был открыт один восьмой, а через год, в девятом классе, остались и вовсе единицы. Некоторые ученики ушли добровольцами на фронт: Фукалов Герман, Ермолаев Василий, Венедиктов Дмитрий, Соколов Леонид, Елькин Георгий. Не все из них вернулись. Вместо ушедших на фронт педагогов и учеников в школу приехали эвакуированные учителя и дети. В годы войны школа-семилетка стала средней.
В тяжёлое для всей страны время школьное обучение не остановилось, а наоборот, прикладывались все усилия для полноценного учебного труда. Постепенно школы пополнялись учебными материалами, литературой. Список учебных пособий насчитывал 36 наименований, среди них: противогазы детские, компасы, глобусы, карты по истории, барометр, атласы, коллекции по минералогии, санитарии и многое другое. Кроме обучения в школе, серьезно велась работа по внешкольной занятости ребят. Была организована работа технических кружков, спортивных секций, военно-прикладных видов спорта (штыковой бой, стрельба, сандружина, строевая подготовка). Большое внимание внеклассным мероприятиям уделяла пионерская и комсомольская организации. Они прививали детям любовь к искусству, чтению художественной литературы, вели кружки: драматический, чтецов, юннатов, антирелигиозный.